发现这里空无一物后，芽衣遇到被灰蛇管理员派来的渡鸦。两人聊过后又打了起来。
渡鸦虽然又战败，芽衣却也因疲劳而精神出现破绽再次被梦境捕获。
灰蛇管理员也因渡鸦在聊天过程中给予了芽衣提示而认为渡鸦背叛，并对她说如果芽衣成功逃出将杀死她。
芽衣在与自己的第二人格和解后逃了出来，并与管理员在星球目录中展开战斗。
而此时，在月球上的1904号却策反了对新版圣痕计划恨得切齿拊心的胡狼，胡狼烧毁了自己的圣痕，为1904号伪造了「灰蛇网络」的管理员权限，让1904号得以毁灭「灰蛇网络」。这一切又在先前Λ为管理员送上的「糖衣炮弹」的帮助下更快地实现。
在「灰蛇网络」的最后时刻，1904号与管理员灰蛇对峙，1904号痛斥了管理员那傲慢的想法，认为圣痕计划中帮助人类摆脱童年的部分确实是他们共同的职责，但管理员却愚不可及地搞错了对象，让在圣痕计划中沉睡的人类学会分辨梦境与现实的界限、让「灰蛇网络」崩溃都是能让人类摆脱童年的功业。
最后1904号向管理员告别，走向了无人知晓的未来。
“ （让灰蛇）从乌合之众走向独立自主、从工具走向「人类」......十分美好的祝福，不是吗？ ——哪怕为此牺牲的，是我与你 ”
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