萧铣为人气量狭窄，猜忌心重，管治能力一般。眼见那些开国大将个个恃功自傲、擅杀妄为，心存不满又毫无办法的他竟然宣称罢兵务农，以此剥夺众将兵权。
梁国二号人物、大司马董景珍的弟弟在军中为将，对这项政策深感不满，意图作乱，因事情泄露被杀。董景珍正镇守长沙，萧铣下诏赦免他连坐之罪，让他返回江陵（湖南荆州）。董景珍恐惧之下，献出长沙归顺了大唐。
武德三年（620年）十二月，萧铣派齐王张绣攻打长沙。董景珍对张绣说：“飞鸟尽、良弓藏的典故难道你不知道，为什么还来打我。”张绣置之不理，挥军包围长沙。董景珍正欲突围逃走，被麾下所杀。
萧铣任命张绣为尚书令，不过几天又被萧铣所杀。自此，功臣大将都起了背离念头，兵势日渐衰微，在与大唐的较量中屡处下风。
武德四年（621年）正月，李靖拿着起草好的“夺取萧铣十大策略”，去找夔州（治重庆奉节）总管、赵郡王李孝恭，请他代为奏报。李孝恭看后深表赞同，立即转奏朝廷。
二月初三，李渊让李孝恭制造舟舰，熟悉水战，进讨萧铣。因李孝恭之前没打过仗，特地委派李靖为行军总管，辅佐李孝恭。
李靖劝说李孝恭征召巴、蜀酋长子弟，根据他们才能授予职务，并安置身旁。对外以示恩德，实则当作人质，用以确保后方稳定。
九月份，诏令兵分四路合围江陵，会攻萧铣，其中：
李孝恭为荆湘道行军总管，李靖为行军长史，节制十二总管，率巴、蜀军队从夔州（重庆奉节）顺江东下。
庐江王李瑗为荆郢道行军元帅，出襄州（湖北襄阳市襄州区）向南进攻。
黔州（重庆彭水）刺史田世康经辰州道（湖南怀化），向北进击。
黄州（湖北黄冈）总管周法明自夏口道（武汉汉阳）向西发展。
当月，长江水涨，风高浪急。众将请示李孝恭待水面下降再行进发，李靖说：“兵贵神速！如今萧铣还不知道我军集结，我们乘着水涨发兵，突然抵达江陵，定可将其擒获。”李孝恭采纳了李靖意见，兵发夔州（重庆奉节）。
十月初三，唐军两千余艘战舰沿长江浩荡东下。萧铣君臣认为江水大涨，沿途竟毫无设防。唐军顺利攻陷荆门、宜都（现均位于湖北宜昌宜都），进至夷陵（湖北宜昌东南，长江北岸）。
萧铣大将文士弘率数万精兵屯驻于此，李孝恭挥师猛攻，两战皆胜，缴获战舰三百余艘，梁军溺亡、被杀万余人。
萧铣江州（江西九江）总管盖彦举被唐军声威所慑，以所辖五州来降。
萧铣罢兵务家后江陵城仅有数千士卒，听闻唐军到来，文士弘又大败，慌忙调兵来援。但这些军队都远在岭外，加之道路险阻，仓促间难以聚集，只得动员城内全部兵力出战。
李孝恭准备进攻，李靖说：“这些都是临时拼凑的军队，缺乏相应准备，定然无法长久。不如暂且停泊南岸稍缓一天，他们必会分兵布防，待其兵力分散再行攻击，一定可以轻松取胜。如果急于进攻，他们拼力死战，恐怕对我不利。”
李孝恭没有采纳，留下李靖照看大营，亲率精锐出击，果被梁军所败，退回南岸。梁军士卒争抢唐军物资，人人负重、乱作一团。
留守的李靖见此情形发兵猛攻，梁军大败。李靖乘胜直逼江陵，攻破外城，又攻陷水城，缴获大量舟舰。
李靖劝李孝恭将这些舟舰散布在江水中，众将都说：“这是我们缴获的战利品，应当好好利用，为何平白扔给敌方？”
李靖答：“萧铣领土广阔，南抵岭南，东至洞庭。我孤军深入，如果江陵打不下来，援军又云集而至，我则面临内外受敌的局面。到那时，即便拥有这些舟舰，又能派上什么用场！我们现在把这些船散布江面，让它们顺江而下，前来支援的敌军看到，必会认为江陵已被攻克，不敢贸然前来。等他们查明情况，至少也要一个月左右，江陵早就被我夺占了。”
果然，赶来救援的梁军看到江面上横七竖八的战船迟疑不进。
唐军围攻江陵，内外阻绝的萧铣找来中书侍郎岑文本商议，岑文本劝他投降。萧铣无奈的对群臣说：“天不佑我梁国，不能再抵抗下去了。如果非要玉石俱焚，就会使百姓罹难，不能因我一人而陷百姓于涂炭！”
十月二十一日，萧铣祭告太庙，下令出降。率群臣着素服到达唐军营寨，说道：“该死的只有我萧铣一人，百姓无罪，希望不要侵犯。”
唐军开入城中，李孝恭在岑文本和李靖的劝说下严格约束部伍，做到了秋毫无犯。南方州县望风请降，萧铣的交州刺史丘和、长史高士廉、司马杜之松，在救援途中听闻萧铣兵败，降于大唐。
数天之内，十余万援军相继放下武器降唐。
萧铣被押往长安问斩。
对于割据势力首领，李渊态度素来明确。凡主动前来归附的，比如李密、郭子和、杜伏威，只要听话，那就高官厚禄豢养起来。如若力战被俘，不管你是明君还是庸主，一律处死！
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